请问能否在同一个虚拟空间里放两个不同的网站，域名不同，内容也不同的两个网站。因为空间很大，剩余了90%

可以的。可以放几百个网站。
只要一条语句就可以了。
if(resquest.servername==第一个域名)
跳转到index1.html
else if(resquest.servername==第二个域名)
跳转到index2.html

一个作者不可以同时在两个网址写小说？（关于网络作家的问题）

第一个问题， 这得看你是属于什么类型的签约，如果只是单本小说的版权签约是完全可以的，如果签约是连人一起签进去的话是不行滴，也就是说，你想两边网站都签约，就必须在两家网站都签单本小说的版权。不能把你自己也签进去任何一家。
第二个问题，起点中文网是属于比较大的一个小说网站，人气较高，写作的作家太多，所以起点不需要借助别的小说来堆攒人气。所以就一般不会出现盗用版权的问题，当然，也有可能是怕惹上官司等。然而在别的小说网站能找到中文网的书，但是不需要付费阅读的，属于免费性质，这牵扯商业战争的问题，利用他人的小说名气来推销自己网站的产品。这是各大网站间的一种互相利用，因为对中文网来说，收入与付出不等。

同一部小说可不可以同时跟两个网站签约？如果签了后果会怎样？

这要看你签的是什么版权。。如果你是超级大神，只要能谈拢，电子版权签A站，简/繁体出版权签B站，游戏改编权签C站，这都是可以的。
不过真要做到，很难。
现在的网站都是贪婪的，不可能会轻易让版权落到别人手里